作为灵活用工咨询专家，我知道“灵活用工支付的工资怎么做账”这个问题一直困扰着许多企业，但这并不是无法解决的难题。让我带你走进灵活用工的世界，探寻答案吧。

在我国，灵活用工已经成为一种越来越普遍的用工方式。企业通过灵活用工，可以在需要时方便地增加或减少劳动力，以适应市场需求的变化。但同时这也带来了一个问题：灵活用工的工资支付和做账应该如何处理呢？

我们要明确的是，无论是固定员工还是灵活用工，工资的支付和做账的基本原则都是相同的。企业应按照国家有关法律法规和企业的内部规定，按时足额支付工资，并在税法规定的期限内为员工缴纳各项社会保险。

对于灵活用工，企业还需要注意以下几点：

1. 合同签订。企业应与灵活用工签订正式的劳动合同，明确双方的权利和义务，包括工资支付标准、支付时间、工作地点等内容。这既是对双方的权益保障，也是税务部门认可工资支付的依据。

2. 工资结构。企业应根据实际工作量和工作质量，合理确定灵活用工的工资结构，包括基本工资、绩效工资、奖金等。同时企业还需要了解各地关于最低工资标准的规定，确保工资支付符合当地法规。

3. 税收问题。企业应按照税法规定，为灵活用工代扣代缴个人所得税。同时企业还需要为灵活用工办理社会保险登记，并按时缴纳社会保险费。

4. 做账凭证。企业应建立健全财务制度，对于灵活用工的工资支付，应保存好相关凭证，包括劳动合同、工资单、支付凭证等，以便在税务部门进行查验时提供。

总结：灵活用工的工资支付和做账并没有想象中的复杂，只要企业依法依规操作，就可以有效避免可能出现的法律风险。当然，如果企业在这方面还有疑问，建议寻求专业人士的帮助，以确保万无一失。